Margarethenkirche
Im Jahre 1064 wurde die Kirche erstmalig erwähnt. Gut dreihundert Jahre später bekamen die Zisterzienserinnen das Patronatsrecht über die Kirche und es gab eine Lateinschule. 1495 wurde eine Orgel eingebaut.
Beim großen Stadtbrand 1630 wurden das Innere des Pfarrhauses und der Kirche zerstört.
Ab 1632 wurde das Gotteshaus ausgebaut.
1725 bis 27 bekam die Kirche eine barocke Innenausstattung. Ein Jahr darauf war das große Grabmal der Herzogsfamilie fertig gestellt.
1812 wirkte beim deutschen Musikfest in der Margarethenkirche der Komponist und Pianist Carl Maria von Weber mit. Die Leitung hatte der Gothaer Hofkapellmeister Louis Spohr.
Der Margarethenkirchenchor wurde 1896 gegründet.
1989- 91 wurde die Margarethenkirche umfangreich rekonstruiert.
Augustinerkirche
Das Kloster wurde 1216 von Zisterziensernonnen gegründet und später von Mönchen des Augustiner-Eremitn-Ordens übernommen.
Martin Luther prädigte in diesem Kloster 1515, 1516 und 1521 .